Câu truyện xoay quanh Inari Fushimi, một cô gái nhút nhát, không nổi tiếng lắm khi học cấp 2, và hiện đang sống tại ngôi đền Fushimi ở Kyoto. Cô bé đã đem lòng yêu một cậu bạn cùng lớp tên Tanbabashi, nhưng không thể thổ lộ tình cảm của mình. Một ngày nọ, cô bé đã cầu xin sự giúp đỡ của vị thần Cáo, Ukanomitamanokami và ngài ấy đã ban cho cô bé sức mạnh có thể chuyển đổi hình dạng của mình.
Trong những hoạt động ngầm nguy hiểm của thành phố Academy là linh lực gia cấp 5 Accelerator. Anh có thể tiêu diệt bất cứ ai nhờ năng lực của mình, năng lực này cho phép anh tạo ra một trường mỏng của mục tiêu xung quanh anh và chi phối véc tơ của bất cứ thứ gì anh chạm vào. Suốt cuộc đời của Accelerator, anh luôn là đối tượng bị tấn công, do đó, anh mất niềm tin vào con người và chỉ tin vào sức mạnh.
Kotarou Azumi và Akane Mizuno đã trở thành học sinh năm thứ ba ở trường trung học cơ sở và là bạn học cùng lớp lần đầu tiên. Hai người cùng với các bạn học cùng lớp, Chinatsu Nishio và Takumi Hira liên quan đến những người bạn của họ thông qua những hiểu biết và cảm xúc lẫn nhau. Khi năm cuối cùng của họ ở trường trung học cơ sở tiến triển, nhóm vượt qua những thách thức để trưởng thành và nhận thức được những thay đổi trong chính họ.
Phần chính của cốt truyện diễn ra tại một trường trung học ở Nhật Bản. Nhân vật Kyousuke từng nhận xét rằng "thế giới này có một bí mật", Kengo và Masato cũng để ý đến điều đó. Các nhân vật sống trong một ký túc xá nam và nữ được xây tiếp giáp với khuôn viên trường.
Amaumi Haruhiko là một học sinh trung học tham dự Shimano Academy trong một thị trấn tên là Narasakicho. Narasakicho chứa một cầu vồng chưa biết mà liên tục nhìn ra thành phố và có liên quan đến việc cấp một mong muốn huyền diệu gọi là ” quà tặng “. Món quà là một món quà một lần – trong-một- đời giữa hai người